De farmacotherapeutische aanbevelingen van de Multidisciplinaire Richtlijn Schizofrenie 2005 worden vergeleken met die van het Farmacotherapeutisch Kompas 2005 en met die van internationale richtlijnen. Het Farmacotherapeutisch Kompas 2005 adviseert te starten met haloperidol; de internationale richtlijnen adviseren een atypische middel te kiezen. De Multidisciplinaire Richtlijn Schizofrenie 2005 adviseert voor- en nadelen samen met de patiënt te wegen en de keus daarop te baseren. Als een dergelijke weging problematisch blijkt wordt geadviseerd om aan een atypisch middel de voorkeur te geven.